1.首先要注意自查自纠的主体。要明确上面要求的自查自纠主体是单位、企业还是个人，对症下药，避免牛头不对马嘴的开展工作。
2.要注意深入分析自查内容。根据自查的要求，逐条逐款的比对自查主体存在的问题，尽量做到每个方面的内容都深入查找一遍，不能敷衍了事。如果自己自查不出的问题，被检查方调查出来，那么问题的严重性明显要高于自己查找出来的。
3.要注意比对行业法律法规深入自查剖析。如环境保护部门或环保部门工作人员自查自纠，应该多从行业法规方面开展自查，自己的职责是否严格按照《环保护法》等行业法规履行，是否存在违法违规行为。
4.查找出的问题及时解决。自纠即查找出问题后及时纠正，承认错误要诚恳，处理错误的态度要端正，能找打解决措施的提出解决措施，摆正自身姿态，逐步按照措施改正错误。
5.注意做好自查资料的整理工作。自查主体要认真准备自查涉阅的资料，自觉接受检查机关检查。认真做好备查资料的整理、装订、标识、保管等工作，这样既能节约检查时间，又能提高检查质量。
6.写好自查自纠报告。自查自纠报告是自查自纠工作的总结性材料，要高度重视，自查自纠报告要涵盖需查找问题的每个方面、查处的问题、整改方法、下一步打算和计划等。
